Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms