Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RORCP51449 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RORCP51449 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RORCP51449 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORCP51449 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms