Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTPAP49638 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTPAP49638 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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