Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms