Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFNP31947 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFNP31947 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms