Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms