Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TSPOP30536 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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