Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms