Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms