Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms