Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms