Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A1P11836 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms