Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms