Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms