Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL41O60662 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms