Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN2O60636 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms