Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHST1O43916 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHST1O43916 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHST1O43916 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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