Protein–RNA interactions for Protein: O43823

AKAP8, A-kinase anchor protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP8O43823 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AKAP8O43823 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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