Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD6O43541 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms