Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms