Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF4O00268 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF4O00268 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF4O00268 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms