Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms