Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DGG1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DGG1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DGG1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DGG1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms