Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms