Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC182A6NF36 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms