Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GMNCA6NCL1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GMNCA6NCL1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GMNCA6NCL1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GMNCA6NCL1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GMNCA6NCL1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GMNCA6NCL1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GMNCA6NCL1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms