Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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