Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED23Q9ULK4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms