Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms