Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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