Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms