Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms