Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA1Q9NP55 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms