Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP29Q9HBJ7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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