Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms