Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms