Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms