Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF1Q9BSM1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms