Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms