Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNBD2Q96M20 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms