Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms