Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms