Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms