Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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