Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FGD6Q6ZV73 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms