Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC9Q6ZRR7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC9Q6ZRR7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms