Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC73Q6ZRK6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms