Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USPL1Q5W0Q7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USPL1Q5W0Q7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms