Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms