Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms